FreeBSD9.xでバグを踏んだみたいです。
同じ現象が起きた人の為にメモ。
今まで名前解決ができていたのに、hostをrebootをしたらjail内で名前解決ができなくなってしまいました。
エラー内容はpingの場合だと、
ping: cannot resolve Host name lookup failure。
しかしdrill(unbound)はできる。
それ以外のapacheやpingなどが全て名前解決ができなくなりました。
解決方法は、10.0-RELEASEにupgradeをすることです。これで直りました。